Em G.I. Joe The Rise of Cobra o jogador pode jogar com todos os Joes, entre as classes estão Commando, que tem facilidade em combates a curta distância, Heavy Weapons, que possuem habilidades extraordinárias com armas de fogo, o Soldier, que tem o equilíbrio, entre as outras duas classes. O famoso grito de guerra “Yo Joe” está presente no jogo, servindo como poder de invulnerabilidade para quando um personagem ganha acesso ao Acelerador de Armadura.
Depois dos eventos do filme, Duke e Scarllet vão para o Ártico para libertar Heavy Duty, Snake Eyes e Ripcord do Centro de Detenção M.A.R.S. Assuma o controle da equipe de elite G.I. Joe enquanto deverá luta contra as mais poderosas forças do mal de Cobra. Sendo uma adaptação direta do filme, embarque nesta grande historia e experimente grandes surpresas e batalhas épicas.