Happy Feet 2 compartilha a mesma história do filme de animação. Os jogadores seguem Mumble e seus amigos pinguins enquanto eles trabalham para resgatar os pinguins filhotes em uma variedade de paisagens da Antártida. A jogabilidade progride através de uma variedade de mini-jogos e desafios diferentes, como descidas de pistas de gelo, colecionar notas musicais e executar rotinas de dança em tempo real para a música de fundo.
Os jogadores podem usar as habilidades distintas de cada novo pinguim desbloqueado, para atordoar os inimigos e progredir nas missões em toda antártica. Vários quebra-cabeças devem ser resolvidos trabalhando cooperativamente para manipular o ambiente. Durante a cantoria os jogadores vão cantar as músicas da banda Ozomatli, que apresenta uma mistura eclética de hip-hop, samba, merengue, salsa, funk e outras influências.